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Formation tout au long de la vie

Institut national supérieur des sciences agronomiques, agroalimentaires, horticoles et du paysage

Galaxy : Traitement de données de séquences par Galaxy

TYPE DE FORMATION : Inter-entreprise

En partenariat avec :

Logo partenaire

Contexte

AGROCAMPUS OUEST, en lien avec la plateforme Bioinformatique GenOuest et l'INRA, propose une formation centrée sur l'analyse de données haut-débit issues des microarrays et des technologies de séquençage haut-débit (RNA-seq et ChIP-seq) incluant les traitements bio-informatiques (RNA-seq et ChIP-seq), les traitements statistiques (microarrays et RNA-seq) et l'interprétation biologique de listes de gènes d'intérêt jusqu'à la réalisation et visualisation de réseaux de gènes. Cette formation a pour objectif de vous donner les éléments théoriques et pratiques vous permettant d'être autonome dans l'analyse de vos données. Cette formation à la carte se compose de 8 modules indépendants, les 2 premiers modules destinés à des débutants, permettent d'acquérir si nécessaire, les prérequis informatiques à R et/ou UNIX.

Objectifs

Présenter l'environnement Galaxy, convivial d'utilisation pour celles et ceux qui seraient réfractaires à la programmation sous UNIX et R, et vous accompagner dans sa prise en main.

Programme

1- exposé théorique

2- démonstrations pratiques complétées par quelques applications sur la manipulation de données de régions génomiques et sur l'analyse de jeux de données de type NGS (détection de SNP, analyse de données RNA-seq et ChIP-seq).

Responsable(s)

Sandrine LAGARRIGUE
AGROCAMPUS OUEST

Public concerné

Acteurs de la recherche et de la R&D
Doctorants
Secteur public et privé

Pré-requis

Aucun

Session(s)

• 4 février 2019

S'inscrire

Tarif : 370 euros

Lieu : AGROCAMPUS OUEST, Campus de Rennes

 


Document non contractuel

CONTACTS

AGROCAMPUS OUEST

Service de formation continue

formco@agrocampus-ouest.fr

Campus de Rennes
tél : +33 (0)2 23 48 55 27