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Formation tout au long de la vie

Institut national supérieur des sciences agronomiques, agroalimentaires, horticoles et du paysage

Formation Omic & NGS

AGROCAMPUS OUEST en lien avec la plateforme Bioinformatique GenOuest et l’INRA propose une formation à RENNES centrée sur l’analyse de données haut débit issus des microarrays et des technologies de séquençage haut-débit (en particulier le RNA-seq et le ChIP-seq) incluant les traitements bioinformatiques (RNA-seq et ChIP-seq), les traitements statistiques (cas des microarrays, RNA-seq et Chip-seq) et l’interprétation biologique de listes de gènes d’intérêt jusqu’à la réalisation et visualisation de réseaux de gènes. Cette formation annuelle a pour objectif de vous donner les éléments théoriques et pratiques (avec 3/4 de travaux dirigés visant à analyser des jeux de données réels) vous permettant d’être autonome dans l’analyse de vos données.

Cette formation à la carte se compose de 8 modules indépendants ; les 2 premiers modules destinés à des débutants, permettent d’acquérir si nécessaire, les prérequis informatiques à R et/ou UNIX. Des intervenants d’origine variée ("INRA", "Institut Pasteur", "Programme Cartes d’Identité des Tumeurs" , "Agrocampus Ouest"), à la fois experts dans leur domaine et pédagogues vous accompagneront. Il s’agit de Yuna Blum, David Causeur, Sandrine Lagarrigue, Yvan Le Bras, Frédéric Lecerf, Andréa Rau et Pierre-François Roux.

 

 

Initiation à UNIX et à la gestion des big data21 et 22 janvier - 2 jEn savoir plus
Initiation à R23 et 24 janvier - 2 jEn savoir plus

RNA-seq : Analyse bio-informatique sous UNIX  

Prérequis : Initiation à la gestion de grandes données bio-informatiques (UNIX)

29 et 30 janvier - 2 jEn savoir plus
Galaxy : Traitement de données de séquences par Galaxy4 février - 1 jEn savoir plus

RNA-seq : Analyse statistique

Prérequis : Initiation à R

 7 et 8 février - 2 jEn savoir plus

ChIP-seq 

► Prérequis : Initiation à la gestion de grandes données bio-informatiques (UNIX) et Initiation à R

12 et 13 février - 2 jEn savoir plus

Interprétation de listes de gènes et réseaux de gènes  

Prérequis : Initiation à R

14 et 15 février - 2 jEn savoir plus

Microarray : Analyse statistique

► Prérequis : Initiation à R

25 et 26 mars - 2 jEn savoir plus

 

 

 

 

 

 

 

Contacts

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Service de formation continue

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tél : +33 (0)2 23 48 55 27

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tél : +33 (0)2 41 22 54 55